C

$A$.在给病人输氧时，氧气应从$a$导管进入，即$a$导管连接氧气钢瓶，$b$导管导出；如果导管接反了，会将装置内的水排出。正确；
$B$.在给病人输氧时，氧气应从$a$导管进入，$b$导管导出。这样可以通过水下气泡的多少快慢判断气体的流速。正确；
$C$.用该装置排水法收集气体时，由于氧气密度比水小应短进长出，即气体应从$b$进，水从$a$出；不正确；
$D$.实验室中将该装置盛澄清石灰水，检验二氧化碳气体时要长进短出，气体从$a$导管进入；正确。
故选：$C$。