B

$A$、研制火箭燃料，属于研究、制取新物质，属于化学研究的范畴，故选项错误。
$B$、确定飞船运行轨道，属于物理学领域研究的内容，不属于化学研究的范畴，故选项正确。
$C$、制造飞船芯片，属于研究、制取新物质，属于化学研究的范畴，故选项错误。
$D$、研制火箭外层涂料，属于研究、制取新物质，属于化学研究的范畴，故选项错误。
故选：$B$。