B

$A$、教室的长约$9m$，故$A$错误。
$B$、和平区南京桥（工农桥）长大约是$0.55km$，故$B$正确。
$C$、某普通中学男子百米赛跑纪录约$13s$，故$C$错误。
$D$、正常中学生心跳一次约$1s$，故$D$错误。
故选：$B$。