D

$A$、道尔顿创立了原子学说，意大利科学家阿伏加德罗创立了分子学说，故$A$对应正确；
$B$、拉瓦锡发现了质量守恒定律，故$B$对应正确；
$C$、屠呦呦的贡献是发明了新药青蒿素，既对抗疟疾有特效，还速效低毒，被卫生组织界定为“世界上唯一有效的疟疾治疗药物”，故$C$对应正确；
$D$、门捷列夫在化学上的主要贡献是发现了元素周期律，并编制出元素周期表；拉瓦锡用定量法研究了空气的成分，用定量实验得出空气由氧气和氮气组成的结论，故$D$对应错误；
故选：$D$。