B

$A$、研制运载火箭所需要的燃料，属于研究、制取新能源，属于化学研究的范畴，不合题意；
$B$、确定飞船的运行轨道，属于物理学领域研究的内容，不属于化学研究的范畴，符合题意；
$C$、飞船芯片的制造，属于研究、制取新材料，属于化学研究的范畴，不合题意；
$D$、研制运载火箭外层的耐高温涂料，属于研究、制取新材料，属于化学研究的范畴，不合题意。
故选：$B$。