D

A.自然环境是影响文明发展的因素之一，排除。
B.材料中的两个地区的科技侧重点不同，不能说明哪一个地区的更先进，排除。
C.两大文明都重视农业，都重视科技，都属于农耕文明，并没有根本性的不同，排除。
D.根据“古埃及由于尼罗河泛滥后重新丈量土地的需要，对几何学比较重视……古巴比伦则因为农业生产依靠天文历法，因此其天文历法比较发达。”可得出，不同地区的生产实践有所不同，从而影响到该地区的科学研究方向，因此反映出生产实践的差异影响科技走向，符合题意。
故选：D。