B

$A$.学校教学楼每层楼高约为$3.5m$，故$A$不符合实际；
$B$.中华人民共和国国歌播放的时长约为$46s$，故$B$符合实际；
$C$.骑自行车上学的速度约为$5m/s=18km/h$，故$C$不符合实际；
$D$.八年级学生跑完$800$米的时间约为$3\min$，故$D$不符合实际。
故选：$B$。