C

$A$、化学就是以开发新能源和新材料为目的，$A$说法正确。
$B$、化学能开发新的医药产品，$B$说法正确。
$C$、化学的发展能帮助解决生态问题，$C$说法不正确。
$D$、原子论和分子论是近代化学的基础，$D$说法正确。
故选：$C$。