D

$A$、门捷列夫在化学上的主要贡献是发现了元素周期律，并编制出元素周期表，故选项错误。
$B$、道尔顿在化学上的主要贡献是提出了原子学说，故选项错误。
$C$、拉瓦锡首先通过实验得出空气是由氮气和氧气组成的结论，故选项错误。
$D$、道尔顿在化学上的主要贡献是提出了原子学说，阿伏加德罗在化学上的主要贡献是提出了分子的概念，并创立了分子学说；他们提出“物质是由分子和原子构成的”，原子论和分子学说是认识和分析化学现象及本质的基础，奠定了近代化学的基础，故选项正确。
故选：$D$。