B

$A$.历史上冬季吉林市最低气温可达$-40^{\circ}\mathrm{C}$，一般在$-25^{\circ}\mathrm{C}$左右，故$A$不符合实际；
$B$.做完一套眼保健操的时间约为$5\min$，故$B$符合实际；
$C$.一名中学生的质量约为$50kg$，故$C$不符合实际；
$D$.教室门的高度约为$2m=20dm$，故$D$不符合实际。
故选：$B$。