A

$A$、波义耳最早发现了酸碱指示剂石蕊，故$A$正确；
$B$、拉瓦锡得出了空气由氧气和氮气组成，其中氧气约占空气总体积$\frac{1}{5}$的结论，故$B$错误；
$C$、道尔顿创立了原子论，故$C$错误；
$D$、张青莲教授主持测定了铟等元素的相对原子质量的新值，为相对原子质量的测定做出了卓越贡献，故$D$错误。
故选：$A$。