B

A、镜筒下降时，眼睛从侧面注视物镜，以免肾蕨压坏玻片标本，A正确；
B、显微镜视野亮度的调节：光线强时，用小光圈、平面镜调节；光线弱时，用大光圈、凹面镜调节。以此视野过暗时，应换用凹面镜和大光圈，B错误；
C、显微镜成像是利用光学原理，必须使可见光线穿过被观察的物体，如果不透光就不能在视野中成像。所以，“用显微镜进行观察的时候”，被观察的材料必须是“薄而透明”，这是因为光线能透过材料，C正确；
D、物镜越长，放大的倍数越大，所以换用长度更长的物镜时，看到的细胞数目变少，D正确。
故选：B。