C

$A$、利用化学可以合成许多自然界中存在和不存在的物质，故选项正确；
$B$、化学是以实验为基础的学科，实验是化学研究的重要方法，是化学学习的组成部分，故选项正确；
$C$、化学反应是可以预测和控制的，故选项错误；
$D$、纳米技术的发现使化学在材料、能源、环境和生命科学等方面发挥着重要作用，故选项正确；
故选：$C$。