D

$A$、合成药物保障人体健康，属于化学对人类贡献，故$A$不符合题意；
$B$、生产钢材建筑桥梁，属于化学对人类贡献，故$B$不符合题意；
$C$、化肥促进粮食增产，属于化学对人类贡献，故$C$不符合题意；
$D$、工业废水是水污染的重要原因，不属于化学对人类贡献，故$D$符合题意。
故选：$D$。