①如图$1$，等腰三角形为锐角三角形，
$\because BD\bot AC$，$\angle ABD=40^{\circ}$，
$\therefore \angle A=50^{\circ}$，
即顶角的度数为$50^{\circ}$.
②如图$2$，等腰三角形为钝角三角形，
$\because BD\bot AC$，$\angle DBA=40^{\circ}$，
$\therefore \angle BAD=50^{\circ}$，
$\therefore \angle BAC=130^{\circ}$.
故答案为：$50$或$130$.

①如图$1$，等腰三角形为锐角三角形，
$\because BD\bot AC$，$\angle ABD=40^{\circ}$，
$\therefore \angle A=50^{\circ}$，
即顶角的度数为$50^{\circ}$.
②如图$2$，等腰三角形为钝角三角形，
$\because BD\bot AC$，$\angle DBA=40^{\circ}$，
$\therefore \angle BAD=50^{\circ}$，
$\therefore \angle BAC=130^{\circ}$.
故答案为：$50$或$130$.