C

$A$、氧化物是指含有两种元素，且一种元素为氧元素的化合物，则含有氧元素的物质不一定是氧化物，故推理不正确；
$B$、在化合物中，金属元素一定显正价，非金属元素不一定显负价，如水中氢元素显$+1$价，故推理不正确；
$C$、元素是指质子数相同的一类原子的统称，故推理正确；
$D$、离子为带电的微粒，但原子中，质子和电子也为带电的微粒，则带电的微粒不一定是离子，故推理不正确。
故选：$C$。