C

$A$、物质都是由元素组成的，同种元素可以组成纯净物，如氢气；不同种元素可以组成纯净物，如水，故选项类推错误。
$B$、在化学变化中原子不可再分，分子能再分，能分成原子，故选项类推错误。
$C$、分子保持物质的化学性质，则不同化学性质的物质分子构成不同，故选项类推正确。
$D$、金属元素有正化合价，但非金属元素也有正化合价，如硫酸铜中硫元素显$+6$价，故选项类推错误。
故选：$C$。