B

$A$.稀有气体包括氦气、氖气、氩气等多种气体，属于混合物，故$A$错误；
$B$.单质是由同种元素组成的纯净物，由同种元素组成的纯净物一定是单质，故$B$正确；
$C$.只有一种物质参加的反应不一定是分解反应，例如氧气转化为臭氧的反应，这是一种物质生成另一种物质的反应，不是分解反应，故$C$错误；
$D$.在化学变化中原子不能再分，但分子可以再分，例如水在通电的条件下反应生成水和氧气，水分子分解为氢原子和氧原子，氢原子和氧原子重新组合成氢气分子和氧气分子，故$D$错误；
故选：$B$。