C

$A$、捣碎酒曲，只是形状发生改变，没有新物质生成，属于物理变化，故选项错误。
$B$、谷曲混合，没有新物质生成，属于物理变化，故选项错误。
$C$、发酵成酒，有新物质酒精等生成，属于化学变化，故选项正确。
$D$、泉水勾兑，没有新物质生成，属于物理变化，故选项错误。
故选：$C$。