C

$A$、牙膏中含有单氟磷酸钠、碳酸钙等，属于混合物，故选项说法错误。
$B$、氟含量是$0.14\%$，净含量为$200g$，本牙膏中含氟元素的质量是$200g\times 0.14\%$，单氟磷酸钠的质量一定大于$200g\times 0.14\%$，故选项说法错误。
$C$、单氟磷酸钠$(Na_{2}PO_{3}F)$中钠元素和磷元素的质量比是$\left(23\times 2\right):31=46:31$，故选项说法正确。
$D$、单氟磷酸钠是由单氟磷酸钠分子构成的，$1$个单氟磷酸钠分子中含有$2$个钠原子、$1$个磷原子、$3$个氧原子和$1$个氟原子，故选项说法错误。
故选：$C$。