B

$A$、由微粒结构示意图可知，第一种的粒子是氢原子，属于非金属元素；第二种的粒子是锂原子，属于金属元素，不都属于金属元素，故选项说法错误。
$B$、由微粒结构示意图可知，这两种微粒的质子数$\gt$核外电子数，都属于阳离子，故选项说法正确。
$C$、由微粒结构示意图可知，第一种的粒子原子的最外层电子数为$2$，但其核外只有一个电子层，属于稀有气体元素的原子，化学性质稳定；第二种粒子是镁原子，最外层电子数是$2$，在化学反应中易失去$2$个电子而形成阳离子，故选项说法错误。
$D$、由微粒结构示意图可知，两种微粒核内质子数分别是$17$、$18$，微粒分别属于氯元素和氩元素，不属于同种元素，故选项说法错误。
故选：$B$。