D

$A$、刚开始时，消耗等量的硫酸，产生的氢气质量相同，后来消耗等质量的铁和镁，两种金属生成的盐中金属元素都为$+2$价，但镁的相对原子质量小于铁，则镁产生氢气较多，该选项不正确；
$B$、不知道溶液的状态是否饱和，因此不一定析出晶体，即使析出晶体也不能判断析出溶质的质量关系，该选项不正确；
$C$、高锰酸钾加热生成锰酸钾、二氧化锰和氧气，根据质量守恒定律可知，固体质量减小，但锰元素质量不变，因此固体中锰元素质量分数增大，该选项不正确；
$D$、氢氧化钠溶液显碱性，$pH \gt 7$，氢氧化钠与盐酸反应过程中，$pH$减小，且盐酸显酸性，则最终盐酸过量，$pH \lt 7$，该选项正确。
故选：$D$。