D

$A$、由同种元素组成的纯净物叫单质，因此单质由同一种元素组成，所以由同一种元素组成的纯净物一定是单质正确，正确但不符合题意，故选项错误；
$B$、由两种或两种以上的元素组成的纯净物叫化合物，因此化合物中含有不同种的元素，则一种元素不可能组成化合物正确，正确但不符合题意，故选项错误；
$C$、氧化物中一定含有氧元素，但含有氧元素的化合物不一定是氧化物正确，如高锰酸钾不是氧化物，正确但不符合题意，故选项错误；
$D$、过氧化氢和水的组成元素相同，则过氧化氢和水的化学性质相同错误，因为过氧化氢和水的分子构成不同，化学性质不同，错误符合题意，故选项正确；
故选：$D$。