C

方法一：设两份碳酸钙的质量均为$100g$，设与盐酸反应生成二氧化碳的质量为$x$，设高温煅烧生成二氧化碳的质量为$y$，
$CaCO_{3}+2HCl=CaCl_{2}+H_{2}O+CO_{2}\uparrow$，
$\ \ \ 100\ \ \ \ \ \ \ \ \ \ \ \ \ \ \ 44$
$\ \ \ 100g\ \ \ \ \ \ \ \ \ \ \ \ \ \ x$
$\frac{100}{44}=\frac{100g}{x}$，
解得$x=44g$

$CaCO_{3}\frac{\underline{\;高温\;}}{\;}CaO+CO_{2}\uparrow$
$100\ \ \ \ \ \ \ \ \ \ \ \ \ \ \ \ 44$
$100g\ \ \ \ \ \ \ \ \ \ \ \ \ \ \ \ \ y$
$\frac{100}{44}=\frac{100g}{y}$，
解得$y=44g$
故选$C$。
方法二：因为碳酸钙的质量相等，由碳元素的质量分数可得其中碳元素的质量也相等。由两个化学方程式$CaCO_{3}+2HCl=CaCl_{2}+H_{2}O+CO_{2}\uparrow$，$CaCO_{3}\frac{\underline{\;高温\;}}{\;}CaO+CO_{2}\uparrow$可以看出，碳酸钙中的碳元素全部进入生成的二氧化碳中，根据质量守恒定律中元素质量在反应前后不变，则生成的二氧化碳中的碳元素也相等，由二氧化碳中碳元素的质量分数可得，两份二氧化碳的质量也相等。
故选：$C$。