A

$A$、金刚石和石墨物理性质差异大，是因为碳原子排列方式不同；$CO$和$CO_{2}$的化学性质不同，是因为分子构成不同；认识完全正确，故选项正确。
$B$、氮气化学性质不活泼，可用作保护气；氧气具有助燃性，但不具有可燃性，不能用作燃料；认识有错误，故选项错误。
$C$、铁、氧气、红磷都是由一种元素组成的纯净物，都属于单质；冰水混合物中只含有水这一种物质，属于纯净物；稀有气体包括氦气、氖气、氩气等物质，属于混合物；认识有错误，故选项错误。
$D$、地壳中含量最多的元素是氧元素；人体细胞中含量最多的元素是氧元素；认识有错误，故选项错误。
故选：$A$。