B

$A$、实验室用高锰酸钾制取氧气，试管口要放一团棉花，故$A$错误；
$B$、氧气的密度比空气大，收集氧气时，应该长进短出，故$B$正确；
$C$、铁丝燃烧实验时，集气瓶底要放少量水或一层细沙，故$C$错误；
$D$、废渣要倒入指定的容器中，不能倒入水池，故$D$错误。
故选：$B$。