D

$A$、“超纯水”、“超纯蒸馏水”中不含量人体必需的微量元素、矿物质，长期饮用无益健康，故$A$错误；
$B$、任何物质都是化学物质，但是有天然与合成之分，故$B$错误；
$C$、二氧化碳不能供给呼吸，二氧化碳无毒，能使人窒息死亡，故$C$错误；
$D$、含碘食盐中的“碘”是指碘元素，故$D$正确。
故选：$D$。