（1）①过滤可以除去不溶性杂质，可以通过过滤去除泥沙等不溶性杂质。
②活性炭具有结构疏松多孔结构，具有吸附性，可以吸附色素和异味分子；
$(2)$按由上到下的顺序排列应该是：用小砾石除去较大的颗粒，再用石英砂除去较小的颗粒，再用活性炭除去色素和异味，最后是蓬松棉，起支撑作用，故装置制作较合理的是$A$；
通过该装置净化后的水还含有可溶性杂质、细菌和微生物，不适宜直接饮用；
$(3)$①分离混合物的一般思路：首先分析混合物的组成成分，然后利用各成分性质的差异，选择合适的方法进行分离，故正确顺序为$acb$；
②自制净水器净水材料的选择需要考虑的因素，包括过滤技术、‌材料的质量和耐用性以及环保无毒等。
故答案为：（1）①过滤；
②疏松多孔；
$(2)A$；不宜；
$(3)$①$acb$；
②过滤技术、‌材料的质量和耐用性等（合理即可）。

（1）①过滤可以除去不溶性杂质，可以通过过滤去除泥沙等不溶性杂质。
②活性炭具有结构疏松多孔结构，具有吸附性，可以吸附色素和异味分子；
$(2)$按由上到下的顺序排列应该是：用小砾石除去较大的颗粒，再用石英砂除去较小的颗粒，再用活性炭除去色素和异味，最后是蓬松棉，起支撑作用，故装置制作较合理的是$A$；
通过该装置净化后的水还含有可溶性杂质、细菌和微生物，不适宜直接饮用；
$(3)$①分离混合物的一般思路：首先分析混合物的组成成分，然后利用各成分性质的差异，选择合适的方法进行分离，故正确顺序为$acb$；
②自制净水器净水材料的选择需要考虑的因素，包括过滤技术、‌材料的质量和耐用性以及环保无毒等。
故答案为：（1）①过滤；
②疏松多孔；
$(2)A$；不宜；
$(3)$①$acb$；
②过滤技术、‌材料的质量和耐用性等（合理即可）。