D

$A$、二氧化碳能使澄清石灰水变浑浊，图中实验，滴入呼出气体中的石灰水变浑浊，滴入空气的石灰水无明显现象，可以比较二氧化碳的含量，故选项能达到实验目的。
$B$、图中实验，放入右边试管中的带火星的木条复燃，可用于探究二氧化锰是催化剂，故选项能达到实验目的。
$C$、图中实验，除了温度不同外，其它条件相同，可用于探究温度对微粒运动速率的影响，故选项能达到实验目的。
$D$、氧气不易溶于水，用图中装置收集氧气时，长导管是出水管，短导管是进气管，图中所示装置错误，故选项不能达到实验目的。
故选：$D$。