B

$A$、遥知不是雪，为有暗香来，是因为花香中含有的分子是在不断运动的，向四周扩散，使人们闻到花香，故选项解释正确。
$B$、金刚石和石墨物理性质差异大，是因为碳原子的排列方式不同，故选项解释错误。
$C$、氧化汞受热分解生成金属汞和氧气，是因为氧化汞分子分成了汞原子和氧原子，然后氧原子重新组合形成氧分子，大量的氧分子聚集成氧气，汞原子直接聚集成金属汞，该事实说明分子是可以再分的，故选项解释正确。
$D$、$H_{2}O$和$H_{2}O_{2}$的化学性质不同，是因为它们分子的构成不同，不同种的分子化学性质不同，故选项解释正确。
故选：$B$。