（1）一个氯离子带有一个单位的负电荷，表示为：$Cl^{-}$，$5$个氯离子就是在氯离子的前面加上数字$5$，表示为$5Cl^{-}$；
$(2)$一个铝离子带有$3$个单位的正电荷，表示为：$Al^{3+}$，$2$个铝离子就是在铝离子的前面加上数字$2$，表示为$2Al^{3+}$；
$(3)$标在元素符号右上角的数字表示离子所带电荷数，因此$Ca^{2+}$中“$2$”表示一个钙离子带$2$个单位的正电荷；
$(4)$硫是$16$号元素，硫原子有$3$个电子层，最外层有$6$个电子，其原子结构示意图为：；
$(5)$由分子构成的物质，分子是保持其化学性质的最小微粒，保持水化学性质的最小微粒是水分子，水分子用$H_{2}O$表示；
故答案为：$\left(1\right)5Cl^{-}$；
$(2)2Al^{3+}$；
$(3)1$个钙离子带$2$个单位正电荷；
$(4)$；
$(5)H_{2}O$。

（1）一个氯离子带有一个单位的负电荷，表示为：$Cl^{-}$，$5$个氯离子就是在氯离子的前面加上数字$5$，表示为$5Cl^{-}$；
$(2)$一个铝离子带有$3$个单位的正电荷，表示为：$Al^{3+}$，$2$个铝离子就是在铝离子的前面加上数字$2$，表示为$2Al^{3+}$；
$(3)$标在元素符号右上角的数字表示离子所带电荷数，因此$Ca^{2+}$中“$2$”表示一个钙离子带$2$个单位的正电荷；
$(4)$硫是$16$号元素，硫原子有$3$个电子层，最外层有$6$个电子，其原子结构示意图为：；
$(5)$由分子构成的物质，分子是保持其化学性质的最小微粒，保持水化学性质的最小微粒是水分子，水分子用$H_{2}O$表示；
故答案为：$\left(1\right)5Cl^{-}$；
$(2)2Al^{3+}$；
$(3)1$个钙离子带$2$个单位正电荷；
$(4)$；
$(5)H_{2}O$。