D

某混合气由$CO$和$CH_{4}$组成，其中氢元素的质量分数为$12\%$，则混合气体中甲烷的质量分数为$12\%\div (\frac{1×4}{12+1×4}×100\%)=48\%$，则其中$CO$的质量分数是$1-48\%=52\%$。
故选：$D$。