D

$A$、加入适量活性炭，搅拌、过滤，能吸附异味和色素，不能除去水中的可溶性钙、镁化合物，不能降低水的硬度，故选项实验设计不能达成预期实验目的。
$B$、酒精在空气中燃烧，与氧气反应生成二氧化碳和水，检验生成物，能确定生成了二氧化碳和水，$CO_{2}$和$H_{2}O$两种物质中含有碳、氢、氧三种元素，根据质量守恒定律，反应前后，元素种类不变，反应物氧气中只含有氧元素，则酒精中一定含有碳、氢两种元素，可能含有氧元素，不能检验酒精中是否含有氧元素，故选项实验设计不能达成预期实验目的。
$C$、$CO_{2}$能与澄清石灰水反应生成碳酸钙沉淀和水，$CO$不与澄清石灰水反应，反而会把原物质除去，不符合除杂原则，故选项实验设计不能达成预期实验目的。
$D$、分别加入少量二氧化锰粉末，产生大量气泡的是$5\%$的过氧化氢溶液，无明显现象的是水，可以鉴别，故选项实验设计能达成预期实验目的。
故选：$D$。