C

$A$、氧气能供给呼吸，利于微生物、细菌的繁殖，不能用于食品包装袋中，故$A$错误；
$B$、二氧化碳不能供给呼吸，能防止食品腐烂变质，但从成本上考虑，在食品包装袋中充入的气体物质最好的是氮气，故$B$错误；
$C$、氮气的化学性质不活泼，非常经济，可以用作食品的保护气，故$C$正确；
$D$、稀有气体在空气中含量较少，不能用于食品包装袋中，故$D$错误。
故选：$C$。