D

$A$、收集一瓶$100$毫升的氧气。$A$中无刻度，故$A$不正确；
$B$、采用$B$装置，从储气的角度应该是把水压出，所以是短进长出，故$B$错误；
$C$、采用$C$装置，从储气的角度应该是把水压出，但是无法把水压出，故$C$错误；
$D$、而$D$中长管进入气体后会上升导致装置内的水被压着从右侧的长管流入量筒。所以既可以储气也可以测量体积。
故选：$D$。