（1）装置二比装置一更合理，因为装置二的小气球在装置后面，有利于空气的流通，气体进入气球会经过铜粉，使气体与铜粉充分接触，使反应更加充分，故装置二比装置一更合理，理由是装置二利于空气流通，可以使反应更充分；
$(2)$用装置二测定氧气的体积分数，需要测定的实验数据是实验前后注射器读数，实验前后注射器之差就是氧气的体积；
$(3)$实验过程中需要过量的铜粉，其目的是将氧气完全消耗；
$(4)$在实验加热过程中，玻璃管上的小气球作用是缓解压强，防止瓶塞冲出；
$(5)$实验完毕，待装置冷却后，应先将气球内的气体全部挤出，再读数，否则会使测得结果偏大，原因是气球内含有气体时会导致反应后读取的注射器数值偏大，导致消耗气体气体积偏大，从而导致测得的氧气的体积分数偏大。
故答案为：（1）装置二；装置二利于空气流通，可以使反应更充分；
$(2)$实验前后注射器读数；
$(3)$将氧气完全消耗；
$(4)$缓解压强，防止瓶塞冲出；
$(5)$偏大；气球内含有气体时会导致反应后读取的注射器数值偏大，从而导致实验结果偏大。

（1）装置二比装置一更合理，因为装置二的小气球在装置后面，有利于空气的流通，气体进入气球会经过铜粉，使气体与铜粉充分接触，使反应更加充分，故装置二比装置一更合理，理由是装置二利于空气流通，可以使反应更充分；
$(2)$用装置二测定氧气的体积分数，需要测定的实验数据是实验前后注射器读数，实验前后注射器之差就是氧气的体积；
$(3)$实验过程中需要过量的铜粉，其目的是将氧气完全消耗；
$(4)$在实验加热过程中，玻璃管上的小气球作用是缓解压强，防止瓶塞冲出；
$(5)$实验完毕，待装置冷却后，应先将气球内的气体全部挤出，再读数，否则会使测得结果偏大，原因是气球内含有气体时会导致反应后读取的注射器数值偏大，导致消耗气体气体积偏大，从而导致测得的氧气的体积分数偏大。
故答案为：（1）装置二；装置二利于空气流通，可以使反应更充分；
$(2)$实验前后注射器读数；
$(3)$将氧气完全消耗；
$(4)$缓解压强，防止瓶塞冲出；
$(5)$偏大；气球内含有气体时会导致反应后读取的注射器数值偏大，从而导致实验结果偏大。