A

$A$、分子、原子、离子都能保持物质的化学性质，由分子构成的物质分子保持物质的化学性质，由原子构成的物质原子保持物质的化学性质，由离子构成的物质离子保持物质的化学性质，故该选项错误；
$B$、原子中，质子数$=$核外电子数，所以原子不显电性，分子是由原子构成的，分子也不显电性；而离子是由原子得失电子形成的，所以带电，故该选项错误；
$C$、分子、原子、离子都很小，故该选项正确；
$D$、分子、原子、离子都能直接构成物质，如水是由水分子构成的，汞是由汞原子构成的，氯化钠是由钠离子和氯离子构成的，故该选项错误；
故选：$A$。