A

A、生物的变异是不定向的，而自然选择是定向的，A错误。
B、自然选择留下来的变异是适应当时环境的，有利于生物生存的，但是当环境发生变化时就不一定适应新环境，B正确。
C、生物进化的总体趋势是从简单到复杂，从低等到高等，从水生到陆生，所以鳃的进化过程体现了生物进化的方向由水生到陆生，C正确。
D、达尔文进化论的核心是自然选择，以及与自然选择相关的生存竞争和渐变，达尔文认为生物个体在长时间的演化中，经过自然选择，其微小的变异积累为显著的变异，于是形成新的物种或新的亚种，所以节肢动物每次微小的变异经过遗传的逐渐积累，最终可能形成新的性状，D正确。
故选：A。