A

$A$、给水加热，水吸收热量，是热传递改变内能；
$B$、压缩空气的过程中，克服空气阻力做功，将机械能转化为内能，是做功改变内能；
$C$、搓手取暖的过程中，克服摩擦做功，将机械能转化为内能，使手内能增加，温度升高，是做功改变内能；
$D$、钻木取火，是克服摩擦做功，将机械能转化为内能，是做功改变内能；
$A$与$BCD$改变物体内能的方式不同，故$A$符合题意。
故选：$A$。