C

$A$、电风扇的主要部件是电动机，不是热机，故$A$错误；
$B$、电风扇工作时主要把电能转化为机械能，故$B$错误；
$C$、由于存在能量散失等，所以电风扇的工作效率不能达到$100\%$，故$C$正确；
$D$、自然界中一切能量的转化和转移都是守恒的，故$D$错误。
故选：$C$。