C

$A$、太阳是太阳系的中心，其他八个行星绕着太阳运动，而太阳不是宇宙的中心。故$A$错误。
$B$、原子是由带正电的原子核和带负电的电子组成的，原子是可以再分的。故$B$错误。
$C$、天体之间存在万有引力，物体是由分子组成的，分子之间有相互作用的引力和斥力，故$C$正确。
$D$、光年表示光一年通过的距离，用光年表示宇宙距离；由于分子很小，所以用纳米量度分子大小，故$D$错误。
故选：$C$。