C

$A$、$a^{4}$与$a^{5}$不属于同类项，不能合并，故$A$不符合题意；
$B$、$a^{3}\cdot a^{3}\cdot a^{3}=a^{9}$，故$B$不符合题意；
$C$、$2a^{4}\cdot 3a^{5}=6a^{9}$，故$C$符合题意；
$D$、$(-a^{3})^{4}=a^{12}$，故$D$不符合题意；
故选：$C$.