B

$A$、核能源于核矿石内的能量，核矿石属于矿产资源，而矿产资源属于不可再生资源，并且是一次能源，故$A$错误；
$B$、核反应堆是利用原子核发生裂变释放能量来工作的，核反应堆中发生的是可控链式反应，故$B$正确；
$C$、核电站的能量转化是：将核能转化为内能，内能转化为机械能，机械能最后转化为电能，故$C$错误；
$D$、核能发电的主要燃料是铀，具有极强的放射性，使用过的核废水对海洋环境有严重的污染，故$D$错误。
故选：$B$。