D

$A$.冬天大量燃煤取暖，煤燃烧会产生大量的污染物，如二氧化硫、氮氧化物和粉尘等，这些污染物会对空气造成严重污染，不利于维护生态环境，故$A$错误；
$B$.工业污水直接排放会污染水体，水中的生物会受到毒害，破坏水生态系统，不利于维护生态环境，故$B$错误；
$C$.有害垃圾深埋地下会污染土壤和地下水，因为有害垃圾中的有害物质会在土壤中扩散，进而影响地下水的质量，不利于维护生态环境，故$C$错误；
$D$.推进低碳交通运输，例如使用新能源汽车、优化交通线路等，可以减少二氧化碳等温室气体的排放，有助于维护人与自然和谐共生的生态环境，故$D$正确；
故选：$D$。