C

$A$、释放瞬间，两球的高度相同，但由于两球的质量不同，所以两球的重力势能不相等，故$A$错误。
$B$、着地瞬间，两球的速度相等，但由于两球的质量不同，所以两球的动能不相等，故$B$错误。
$C$、甲由$P$点运动到$Q$点，重力势能转化为动能，由于忽略空气阻力，所以甲球在$P$点和$Q$点的机械能相等，故$C$正确。
$D$、从释放到着地，两球所受重力做的功为：$W=Gh=mgh$，$h$相同，但质量$m$不同，所以两球所受重力做功不相等，故$D$错误。
故选：$C$。