B

细菌的基本结构有细胞壁、细胞膜、细胞质和DNA集中的区域，没有成形的细胞核；真菌具有细胞壁、细胞膜、细胞质、细胞核，酵母菌是单细胞真菌；病毒没有细胞结构。题干中的病原微生物是单细胞生物，具有细胞壁，细胞内没有成形的细胞核，因此是细菌。
故选：B。