C

A、观察玉米种子胚的结构，应沿种子的中央纵向剖开，即图一中a线纵切，A正确。
B、玉米属于单子叶植物，种子子叶一片，营养物质储存在胚乳里，所以在玉米种子的剖面滴碘液，变蓝的是结构5胚乳，B正确。
C、图中2是胚芽，6是子叶，C错误。
D、胚是种子的主要结构，由2胚芽、3胚轴、4胚根、6子叶，四部分组成，D正确。
故选：C。