D

$A$.被抽取的$100$名学生的数学成绩是样本，故$A$错误；
$B$.八年级每名学生的数学成绩是个体，故$B$错误；
$C$.被抽取的$100$名学生的数学成绩是总体的一个样本，故$C$错误；
$D$.样本容量是$100$，$D$正确；
故选：$D$.