B

对顶角相等，故①为真命题；
同位角相等，两直线平行，故②为真命题；
若$|a|=|b|$，则$a=b$或$a=-b$，故③为假命题；
若$x \gt y$，当$a\neq 0$时，则$a^{2}x \gt a^{2}y$，故④为假命题.
故选：$B$.