A

物质是由分子或原子组成的，原子是由原子核和核外电子组成的，原子核由质子和中子组成，夸克是一种基本粒子，它是构成质子和中子的基本组成部分。夸克非常小，比原子核里的质子和中子还要小。综上所述，以上四种粒子中夸克是最小的，故$A$正确，$BCD$不正确。
故选：$A$。